18.02.2016 17:06 В журнале «Доклады независимых авторов» опубликована статья [Смирнов В.В. Соотнесение функций аминокислот, кодируемых кодонами, с порядком расположения гексаграмм по Вэнь-вану / Доклады независимых авторов. Выпуск 35, 2016, с. 5-16.]
В процессе исследования многоуровневой системы кодирования генетической информации предлагается использовать сопоставление кодонного алфавита с 64-символьным алфавитом гексаграмм, описанных в классической китайской "Книге перемен" ("И цзин"). Применяемый в данной работе авторский способ такого сопоставления позволяет выделить биологически значимые варианты соотнесения единиц генетического кода с гексаграммами. Этот способ учитывает следующее: порядок расположения гексаграмм по Вэнь-вану; смысловые значения, приписываемые гексаграммам; возможность того, что скорость синтеза белка может отличаться при участии в этом процессе различных кодонов, кодирующих одни и те же аминокислоты; информацию о биологических функциях аминокислот; авторское предположение, что одни и те же позиции нуклеотидов в кодоне могут по-разному интерпретироваться рибосомами.
Начиная с 1953 года, когда Фрэнсис Крик, Джеймс Уотсон и Морис Уилкинс открыли структуру молекулы ДНК, исследователями генома пройден большой путь, результатом которого в настоящее время является возможность использования генома человека в качестве индивидуального информационного продукта. Тем не менее ученые признают, что геном расшифрован, но не понят [1]. В частности, все еще выполняются исследования с целью получения обоснований существования многоуровневой системы генетических алфавитов, включающих 4-символьный алфавит азотистых оснований (нуклеотидов), 64-символьный алфавит кодонов (кодирующих тринуклеотидов), 20-символьный алфавит аминокислот и другие алфавиты [2]. Например, обоснования могут базироваться на теории помехоустойчивого кодирования [3,4], на принципе экономии свободной энергии цепочек нуклеотидов [5], на принципе комплементарности [6], на тенденции генома к повышению информационной емкости, проявлением которой являются механизмы альтернативного сплайсинга [7], и др. Результаты недавних исследований генома показали наличие новых еще более глубоких уровней кодирования информации, связанных со скоростью синтеза белков [8], что требует формирования новых и пересмотра ранее предложенных теоретических обоснований, касающихся, например, предполагаемой избыточности 64-символьного алфавита кодонов.
Для решения этих задач оказывается полезным сопоставление кодонного алфавита с 64-символьным алфавитом гексаграмм, описанных в классической китайской "Книге перемен" ("И цзин"). Алфавит гексаграмм можно рассматривать как двухуровневый, поскольку гексаграммы состоят из шести линий, каждая из которых может быть прерывистой или сплошной, образуя 2-символьный алфавит линий. То есть способ кодирования гексаграмм похож на способ кодирования кодонов, отличаясь, по существу, лишь системами счисления. Порядок расположения линий на гексаграммах, группы линий гексаграмм, гексаграммы целиком и порядки расположения гексаграмм могут ассоциироваться с различными аспектами жизни людей, в том числе со структурой и функциями человеческого организма [9]. Вместе с тем, некоторые принципы, положенные в основу "Книги перемен", в частности, связанные с порядком расположения гексаграмм по Вэнь-вану, пока еще остаются не известными [10]. Поэтому нахождение связей между этими двумя системами кодирования информации позволяет лучше понять как смысл, заложенный в "Книге перемен", так и принципы, на которых построен генетический код. [Статья]
